Оценка экологического состояния малых рек актуальна в современных условиях глобального потепления и резких колебаний водности. Методология изучения продукционных свойств экосистемы малых рек разработана недостаточно. В работе рассматриваются растительные пигменты в донных отложениях как показатели для оценки трофического состояния малой р. Ильдь бассейна Рыбинского водохранилища (Верхняя Волга). Приведены литературные данные по основным гидрологическим и биологическим характеристикам реки. Пробы донных отложений отбирали из верхнего 5-сантиметрового слоя на 12 станциях, керны длиной 35 и 70 см — на 2 станциях. Определяли естественную влажность, объемную массу, содержание органического вещества и гранулометрический состав грунтов общепринятыми методами, растительные пигменты — спектрофотометрическим методом. Пространственное распределение растительных пигментов отражает неоднородность биотопов. В илах содержание пигментов в реке меньше, чем в водохранилищах Волги. Верхний и нижний участки р. Ильдь по концентрации осадочных пигментов — мезотрофные, средний — эвтрофный. Описаны преимущества осадочных растительных пигментов для оценки трофического состояния малой реки.