Представлены результаты исследований качества воды в основных водотоках Горьковского водохранилища за 2011-2013 гг., позволяющие определить причины изменения её качества. Выявлены приоритетные загрязняющие вещества в исследуемых реках, к которым относятся марганец, медь, железо, азот аммонийный и трудноокисляемые органические соединения. Дан анализ методов комплексной оценки качества поверхностных вод. Произведена оценка качества воды по показателям индекс загрязнения водотоков (ИЗВ), показатель химического загрязнения (ПХЗ-10) и удельный комбинаторный индекс загрязненности водоемов (УКИЗВ), а также показана возможность использования их для оценки качества водных объектов на примере Ивановской области. Результаты анализа методов оценки качества воды в водотоках показывают, что наиболее полную и достоверную характеристику качества рек дает показатель УКИЗВ.