Результаты молекулярно-генетических исследований показывают, что бактерии, относящиеся к микробиоте внешних покровов рыб, очень разнообразны, а состав и структура бактериальных популяций зависят от окружающей водной среды и от вида рыб. Цель настоящего исследования — идентификация органотрофных микроорганизмов, изолированных с внешних покровов больных рыб из экспозиционных аквариумов. Из соскобов культивировали микроорганизмы, принадлежащие широко распространенным в пресных водоемах родам: Acinetobacter, Aeromonas, Pseudomonas, Flavobacterium, Janthinobacterium и Shewanella. Среди изолированных штаммов определены природные, автохтонные и потенциально патогенные для рыб виды. Идентификация бактерий выявила гетерогенность популяций Aeromonas, Acinetobacter, Pseudomonas и Shewanella. Среди этих микроорганизмов отмечены штаммы, охарактеризованные как патогены рыб, которые могут выступать первичными инфекционными агентами: Aeromonas sobria, A. salmonicida subsp. salmonicida, Acinetobacter johnsonii, Pseudomonas baetica и Shewanella putrefaciens. При проведении микробиологического мониторинга состояния среды обитания в условиях искусственного содержания рыб необходимо учитывать эти виды органотрофных микроорганизмов.