На основании строения капсульного полисахарида выделяют около 90 серотипов Streptococcus pneumoniae. Характеристика серотипового состава возбудителей, циркулирующих на наблюдаемой территории, необходима для планирования мероприятий по вакцинации. Для серотипирования могут быть использованы ПЦР-методики, основанные на серотип-специфических праймерах к генам, вовлеченным в синтез определенного типа капсульного полисахарида