Институт клинической иммунологии СО РАМН был создан 17 апреля 1981 года на основании Приказа Министерства здравоохранения СССР. Основными научными направлениями, согласованными с АМН СССР и Госкомитетом СССР по науке и технике, стали: изучение закономерностей регуляции иммунитета у населения районов Востока страны; изучение механизмов патогенеза и разработка методов диагностики, профилактики и лечения заболеваний, связанных с нарушениями функций иммунной системы.