Методами сканирующей электронной микроскопии были изучены биокластические фосфатные зерна разных месторождений фосфоритов Египта. Они представлены копролитами, костными остатками, фрагментами водорослей. Изображения, полученные с помощью обратнорассеянных электронов, и микропробные анализы различных биокластических зерен показали одинаковую концентрацию фосфора в большинстве зерен. В нескольких костных фрагментах концентрация фосфора несколько уменьшалась за счет замещения апатита кремнеземом. Бактериальная активность в копролитах и костных остатках играет большую роль при изменении химического состава и концентрации породообразующих элементов. Высокие концентрации фтора отмечаются в бактериальных туннелях. Кристаллы пирита растут на фосфатных биокластических зернах и несут информацию о влиянии кислорода на формирование пород