В статье описан методический подход к формированию системы управления инновационной деятельностью фармацевтических предприятий. В его основе – выделение базовых элементов системы управления (организационных, нормативно-правовых, функциональных, технико-экономических, финансовых, кадровых) и обоснование принципиальной схемы их функционального взаимодействия с учетом отраслевых особенностей и ограничений