Куршский залив является гиперэвтрофным водоемом и испытывает значительную антропогенную нагрузку. Периодически на акватории залива отмечаются «гиперцветения» при массовом развитии потенциальнотоксичных синезеленых водорослей. Водоем имеет важное рыбохозяйственное и рекреационное значение, поэтому одной из приоритетных задач является оценка качества его воды