В статье обозначены основные проблемы оценки эффективности инновационных проектов. Обоснована актуальность применения реальных опционов при их оценке. Представлен разработанный алгоритм оценки проектов методом последовательных опционов с учетом стадийности инновационного проекта. Предложен способ оценки риска инновационного проекта в условиях недостатка информации. Приведена сконструированная авторами модель оценки реальных опционов на основе имитационного моделирования