Геологическое строение определяет динамику, химический состав и минерализацию подземных вод. Тектонические процессы оказывают прямое влияние на миграцию химических элементов, присутствующих в составе подземных вод, на изменение степени минерализации вод, на анионокатионный обмен. Геологические структуры и их контактные зоны играют посредническую роль в изменении химического состава, в ионном обмене подземных вод, тем самым в образовании новых химических соединений.