Увидеть больше видимого
В статье идет речь о том, как компьютер может помочь биологу в работе с видимыми глазом объектами.
Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
Увидеть больше
видимого:
компьютерный анализ
изображений в биологии
Доктор биологических наук <...> Возьмем для
начала такую задачу, как учет большого количества объектов
с определенными оптическими свойствами — например,
колоний микроорганизмов на чашках Петри (рис. <...> Эти цилиндрические блюдечки, или чашки, изобрел немецкий
микробиолог Юлиус Петри (1852—1921), ассистент Роберта
Коха. <...> Он же в 1877 году разработал методику выращивания
в них микробных клеток на поверхности или в толще плотной
гелеобразной питательной среды до тех пор, пока колонии не
станут видны невооруженным глазом. <...> Каждая колония — потомки
одной бактерии, и таким образом, например, можно
прикинуть, сколько их было в растворе, из которого делали
посев. <...> Анализы на чашках Петри сравнительно просты, но
трудоемки, длительны, а главное, субъективны. <...> Чтобы ускорить
анализы и сделать их более объективными, созданы компьютерные
счетчики-анализаторы колоний, основные элементы
которых — цифровая видеокамера, осветители и компьютер
с соответствующим программным обеспечением (рис. <...> Если в качестве критерия различий взять
цвет, то можно расщепить изображения на первичные цвета:
красный — синий — зеленый (рис. <...> Похожим образом программа
обучается по форме и размерам колоний, а также по
их различным сочетаниям. <...> 2
Компьютерные счетчики-анализаторы
колоний
микроорганизмов:
вверху— Компанкол-М1
(«Набитех», Россия),
внизу — Sorcerer («Perceptive
Instruments», Великобритания)
Программы
компьютерных счетчиков-анализаторов колоний
способны также измерять линейные размеры и площади
выделенных на изображении структур. <...> Внешний вид колоний — один из признаков, который
используют для таксономической характеристики микроорганизмов. <...> Компьютерный анализ дает объективные
количественные характеристики внешнего вида колоний, например
в виде профилей интенсивности света, отраженного
от них после расщепления по цветам (рис. <...> Цифровая фото- и видеосъемка с компьютерной <...>
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности
Похожие документы: