О СТАТИСТИЧЕСКОЙ СВЯЗИ ЭКСПРЕССИИ ADRA2A И РИСКА РЕЦИДИВА ПРИ РМЖ
Проведен поиск дополнительных параметров, позволяющих прогнозировать риск возникновения рецидива при РМЖ. На основе общедоступных микрочиповых наборов данных выявлена статистически достоверная связь между риском возникновения рецидива и экспрессией а-адренорецептора 2A (ADRA2A). Эта связь подтверждена валидацией, осуществляемой на независимом наборе микрочиповых данных. Установлено, что при оценке риска возникновения рецидива РМЖ достоверность прогноза, основанного исключительно на экспрессии гена ADRA2A, близка к достоверности прогноза, осуществляемого тест-системами “OncotypeDX” и “MammaPrint”. При этом добавление к ADRA2A всего одного или двух дополнительных прогностических маркеров (например, экспрессии гена SQLE или экспрессии генов SQLE, DSCC1) позволяет обеспечить достоверность прогноза, не уступающую достоверности этих тест-систем.
Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
450
Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2014, Том 157, 4
О СТАТИСТИЧЕСКОЙ СВЯЗИ ЭКСПРЕССИИ ADRA2A
И РИСКА РЕЦИДИВА ПРИ РМЖ <...> На основе общедоступных микрочиповых наборов
данных выявлена статистически достоверная связь между риском возникновения реци-
дива и экспрессией -адренорецептора 2A (ADRA2A). <...> Эта связь подтверждена валида-
цией, осуществляемой на независимом наборе микрочиповых данных. <...> Установлено, что
при оценке риска возникновения рецидива РМЖ достоверность прогноза, основанного
исключительно на экспрессии гена ADRA2A, близка к достоверности прогноза, осу-
ществляемого тест-системами “OncotypeDX” и “MammaPrint”. <...> При этом добавление к
ADRA2A всего одного или двух дополнительных прогностических маркеров (например,
экспрессии гена SQLE или экспрессии генов SQLE, DSCC1) позволяет обеспечить досто-
верность прогноза, не уступающую достоверности этих тест-систем. <...> Ключевые слова: экспрессия гена, рак молочной железы, риск рецидива, адренорецептор 2A
РМЖ является гетерогенным заболеванием. <...> Точность алгоритмов прогнозирования за
болевания на основе “классических факторов”
может быть существенно скорректирована при
применении молекулярнодиагностичестических
тестсистем на основе оценки экспрессии мРНК
в образце опухоли (“OncotypeDX”, “MammaPrint”
и т.д.) <...> Так, диагностическая чувствительность тестсис
темы “OncotypeDX”, составляет 7080% при спе
цифичности 6065% [4]. <...>
ОБЩАЯ ПАТОЛОГИЯ И ПАТОЛОГИЧЕСКАЯ ФИЗИОЛОГИЯ
МЕТОДИКА ИССЛЕДОВИНИЯ
Для поиска информативных показателей прогно
за риска развития метастазирования использо
вались общедоступные наборы микрочиповых
данных GSE17705, GSE6532, GSE12093, пред
ставляющие собой результаты полногеномного
транскриптомного анализа биопсийного материа
ла, осуществлявшегося на микрочипах Human
Genome U133A array (“Affymetrix”) по протоколу
производителя. <...> Анализируемые данные микрочиповых ис
следований были совместно предобработаны,
после чего проводилась оценка экспрессии <...>
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности
Похожие документы:
РУАЭСТ (RUAEST)