РУсскоязычный Архив Электронных СТатей периодических изданий
Вопросы нормативно-правового регулирования в ветеринарии/2015/№ 2/
В наличии за
80 руб.
Купить
Облако ключевых слов*
* - вычисляется автоматически
Недавно смотрели:

ПОДХОД К ПОДБОРУ ДНК-МИШЕНИ К ТЕСТ-СИСТЕМЕ ПЦР ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПРОВИРУСА ЛЕЙКОЗА КРС

Рассмотрен принцип взаимодействия вирусов и клеток, исходя из которого определена стратегия подхода к подбору молекулярно-генетической тест-системы вируса лейкоза КРС. Рассмотрены подходы определения области ДНК-мишени, алгоритм подбора и дизайна праймеров. Проведен анализ более 50-ти наиболее дискордантных последовательностей нуклеиновых остатков области LTR BLV в плане выявления мотивов (наиболее консервативных последовательностей). Последующая обработка представлена с использованием алгоритма программы вектор NTI и выравниваем последовательностей с использованием алгоритма BLAST NCBI. Длина ДНК-мишени проектировалась в диапазоне 150-200 пар нуклеотидов. Разработанная тест-система работает, как в простом диапазоне ПЦР с анализом электрофоретической подвижности амплифицированного фрагмента провируса ВЛКРС, так и подобрана система для проведения ПЦР в режиме реального времени.

Авторы
Тэги
Тематические рубрики
Предметные рубрики
В этом же номере:
Резюме по документу**
УДК 619:616 =07.006 ПОДХОД К ПОДБОРУ ДНК-МИШЕНИ К ТЕСТ-СИСТЕМЕ ПЦР ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ПРОВИРУСА ЛЕЙКОЗА КРС Маркарян А.Ю. <...> Рассмотрен принцип взаимодействия вирусов и клеток, исходя из которого определена стратегия подхода к подбору молекулярно-генетической тест-системы вируса лейкоза КРС. <...> Рассмотрены подходы определения области ДНК-мишени, алгоритм подбора и дизайна праймеров. <...> Проведен анализ более 50-ти наиболее дискордантных последовательностей нуклеиновых остатков области LTR BLV в плане выявления мотивов (наиболее консервативных последовательностей). <...> Последующая обработка представлена с использованием алгоритма программы вектор NTI и выравниваем последовательностей с использованием алгоритма BLAST NCBI. <...> Длина ДНК-мишени проектировалась в диапазоне 150-200 пар нуклеотидов. <...> Разработанная тест-система работает, как в простом диапазоне ПЦР с анализом электрофоретической подвижности амплифицированного фрагмента провируса ВЛКРС, так и подобрана система для проведения ПЦР в режиме реального времени. <...> Вызывает заболевание вирус BLV (Bovine leukemia virus), который относят к роду Deltaretrovirus. <...> При создании тест-систем для выявления инфицированных животных необходимо учитывать не только принцип воздействия вируса на клетку, но также и воздействие клетки на вирус, как два совместно действующих модуля. <...> Так, на сегодняшний день только на основе анализа полиморфизма длин рестриктных фрагментов (ПДРФ) структурного гена env ВЛКРС отражено семь генетических вариантов, и такая вариабельность представлена, более или менее во всех структурных генах вируса, что собственно нетрудно рассмотреть при первичном анализе последовательностей ДНК в базе данных GenBank NCBI. <...> При данном положении и тривиальном подходе по подбору праймеров для разработки тест систем кажется логичным множественный подбор всех вариантов праймеров, учитывающих изменчивость вириона, однако данный тезис отрицается конкурирующим антагонизмом взаимодействия вариабельных <...>
** - вычисляется автоматически, возможны погрешности

Похожие документы: