В статье изложена методика исследований геоморфологической инфраструктуры глубинных неоднородностей литосферы на разных организационных уровнях. Она охватывает как создание простых тонометрических моделей на снимках, так и выявление сложных взаимодействий тонометрических, морфоструктурных, геофизических и геохимических аномалий, рассмотренных на количественном уровне. Применение методики на мегаструктурном уровне построения сложных структурных моделей может дать неожиданный новый результат в изучении их генезиса и размещении новых рудоперспективных площадей. На уровне изучения малых структурных форм методика предусматривает поиски новых продуктивных структурных узлов при доизучении старых рудных районов.