Дивергентная структура Юго-Западного Гиссара связана с крупномасштабным пододвиганием под регион тыловых сооружений Таджикской депрессии и общим надвиганием орогена в северо-западном направлении, на структуры Бешкентского прогиба. Складчато-надвиговые деформации преобладают в структуре региона, поэтому почти все его поверхностные образования являются аллохтонными. Это обстоятельство сильно затрудняет изучение глубинного, поднадвигового этажа Юго-Западного Гиссара, в которым локализованы основные источники углеводородов. Динамическое моделирование региональной структуры, включающей пачки сверхпластичных пород и образованной в условиях покровно-складчато-сдвиговых деформаций, позволяет наметить наиболее перспективные уровни структурных ловушек этого потенциально очень богатого нефтегазового бассейна.