Рецидивы после лапароскопической фундопликации при лечении желудочно-пищеводного рефлюкса у детей являются одной из актуальных проблем в детской хирургии. В отделении торакальной хирургии и хирургической гастроэнтерологии ДГКБ № 13 им. Н.Ф. Филатова разработана и внедрена в практику модификация лапароскопической фундопликации по Ниссену, которая позволяет добиться снижения числа повторных операций в 2 раза. В результате эффективность лечения достигает 92%. Опыт лечения данной категории больных был проанализирован в ходе ретроспективного исследования с проведением статистического анализа сравнительных результатов. Выборка составила 345 пациентов. Получены данные о влиянии методики операции и выявлены статистически значимые факторы риска развития рецидивов. Достоверность подтверждена методом многофакторного логистического регрессионного анализа. Было установлено, что методика операции является независимым фактором риска развития рецидива. Другим фактором, влияющим на исход первичной операции, следует считать наличие грыжи пищеводного отверстия диафрагмы. Таких пациентов необходимо рассматривать как группу риска по развитию рецидива. Доказано, что модифицированная методика фундопликации позволяет повысить эффективность хирургического лечения в данной группе также в 2 раза.