Обследовано 110 больных пародонтитом (группа наблюдения) и 60 пациентов без патологии пародонта (группа сравнения). С помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) исследованы образцы слюны и содержимое пародонтальных карманов для выявления видоспецифических фрагментов ДНК Porphyromonas gingivalis, Streptococcus macacae, S. mutans, S. oralis, S. salivarius, S. sanguis, S. sobrinus, Treponema denticola. У больных пародонтитом в содержимом пародонтального кармана зубов достоверно чаще обнаруживали S. mutans, S. oralis, S. sobrinus, в слюне – S. mutans, S. sobrinus. В группе наблюдения значимо превышена частота выявления ассоциации S. mutans – S. oralis – S. sanguis – S. sobrinus (на 15,6%; χ= 9,1; р = 0,004). Через 10 дней эффективного лечения пародонтита наблюдалось достоверное снижение частоты обнаружения S. oralis, S. sobrinus в содержимом пародонтальных карманов, но не в слюне. Выявление S. sobrinus методом ПЦР в содержимом пародонтальных карманов и/или слюне у больных пародонтитом имеет диагностическое значение. Обнаружение S. sobrinus (ПЦР) в содержимом пародонтальных карманов значимо как в монокультуре, так и в ассоциации S. mutans – S. oralis – S. sanguis – S. sobrinus. Отсутствие S. sobrinus (ПЦР) в содержимом пародонтальных карманов свидетельствует об эффективности лечения основного заболевания (пародонтита).