В современной медицине сравнение соотношений микроорганизмов людей в норме и при различных заболеваниях, позволяет установить их влияние на развитие патологических процессов. Понятия микробиом и метагеном были введены в конце прошлого века. Осуществлены ряд международных проектов в области микробиологии с применением традиционных и современных молекулярно-генетических методов выявления микроорганизмов: гибридизационные, амплификационные методы, а также секвенирование нуклеиновых кислот. Анализ литературных данных по изучению индивидуального состояния микробиоты различных органов и тканей человеческого организма, позволяет считать микробиоту и метагеном объектами исследования в персонализированной медицине.