РУАЭСТ (RUAEST)
МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СИКВЕНС-ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE РАЗНОЙ ЭПИДЕМИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТИ
Проведено исследование аллельного полиморфизма генов «домашнего хозяйства» (dnaE, lap, recA, pgm, gyrB, cat, chi, gmd) штаммов Vibriocholerae разной эпидемической значимости (n= 41), изолированных на территории Сибири и Дальнего Востока в период VII пандемии холеры. Установлено, что все токсигенные штаммы периода эпидемических осложнений независимо от времени и источника выделения характеризуются идентичным аллельным профилем и относятся к одному сиквенс-тииу. Среди эпидемически неопасных изолятов выявлено 9 сиквенс-тинов и кластеризация их на дендрограмме, ассоциированная с принадлежностью к серогруппе и, в ряде случаев, с территорией и временем выделения. Гетерогенность структуры генов «домашнего хозяйства», нетоксигенных V. cholera, обусловлена преимущественно синонимичными нуклеотидными заменами (Dn/Ds<l), что свидетельствует о преобладании на анализируемых участках генома холерного вибриона отрицательного отбора. Выявленные различия структуры генов «домашнего хозяйства» холерного вибриона разной эпидемической значимости могут свидетельствовать о разных направлениях эволюции этих групп штаммов.