МУЛЬТИЛОКУСНОЕ СИКВЕНС-ТИПИРОВАНИЕ ШТАММОВ VIBRIO CHOLERAE РАЗНОЙ ЭПИДЕМИЧЕСКОЙ ЗНАЧИМОСТИ

Проведено исследование аллельного полиморфизма генов «домашнего хозяйства» (dnaE, lap, recA, pgm, gyrB, cat, chi, gmd) штаммов Vibriocholerae разной эпидемической значимости (n= 41), изолированных на территории Сибири и Дальнего Востока в период VII пандемии холеры. Установлено, что все токсигенные штаммы периода эпидемических осложнений независимо от времени и источника выделения характеризуются идентичным аллельным профилем и относятся к одному сиквенс-тииу. Среди эпидемически неопасных изолятов выявлено 9 сиквенс-тинов и кластеризация их на дендрограмме, ассоциированная с принадлежностью к серогруппе и, в ряде случаев, с территорией и временем выделения. Гетерогенность структуры генов «домашнего хозяйства», нетоксигенных V. cholera, обусловлена преимущественно синонимичными нуклеотидными заменами (Dn/Ds<l), что свидетельствует о преобладании на анализируемых участках генома холерного вибриона отрицательного отбора. Выявленные различия структуры генов «домашнего хозяйства» холерного вибриона разной эпидемической значимости могут свидетельствовать о разных направлениях эволюции этих групп штаммов.

• Балахонов С.В.
• Афанасьев М.В.
• Миронова Л.В.
• Гольдапель Э.Г.

• Прикладные науки. Медицина. Технология

• Естественные науки
• Науки о человеке