ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ИЗОЛЯТОВ МИКОБАКТЕРИЙ ТУБЕРКУЛЕЗА ИЗ Республики САХА (ЯКУТИЯ), РОССИЯ

Методом MIRU-VNTR-генотипирования по 24 локусам оценена популяционная структура M. tuberculosis в Республике Саха (Якутия). Исследовано 199 штаммов, выделенных от 199 больных туберкулезом легких. Наибольшее количество штаммов — 34,2% (68/199) принадлежало генотипу Beijing. Среди изолятов генотипа Beijing выявлено значимое преобладание (χ = 15,5; p < 0,001) множественной и широкой лекарственной устойчивости (MDR/XDR) у субтипа CC2/W148 — 9,5% (19/199). Штаммы генотипа S — 15,6% (31/199) были вторыми по распространенности после генотипа Beijing. Большинство S-штаммов имели идентичный профиль 233325153325141344222372. Штаммы генотипа S значимо чаще несли MDR или XDR (χ= 59,8; p < 0,001) среди non-Beijing изолятов. Штаммы генотипа Ural занимали третье место по распространенности — 10,0% (20/199). К семейству LAM относилось 8,5% (17/199) штаммов, отличавшихся значительной генетической гетерогенностью. Также большим генетическим разнообразием отличались минорные генотипы Т и Haarlem. Проведено филогенетическое моделирование заноса МБТ эпидемических генотипов S и субтипа CC2/W148 генотипа Beijing на территорию Республики Саха (Якутия) с оценкой вероятного времени по шкале, предложенной M. Merker и соавт. (2015). Показано, что штаммы субтипа CC2/W148 принадлежат 4 филогенетическим сублиниям и занесены на изучаемую территорию в исторически недавние сроки, то есть в XX веке. Проведена оценка филогенетических взаимоотношений 30 MIRU-VNTRпрофилей штаммов S-семейства из Республики Саха (Якутия) и 31 референсного S-профиля от штаммов из Европы и Канады. Профили генотипа S из Республики Саха (Якутия) образуют филогенетически компактную группу, свидетельствующую о том, что вся эволюционная история этих штаммов прошла на территории этой республики. Время заноса предкового генотипа S на территорию Якутии оценено диапазоном 300—600 лет.

• Алексеева Г.И.
• Астафьев В.А.
• Винокурова М.К.
• Жданова С.Н.
• Кравченко А.Ф.
• Огарков О.Б.
• Савилов Е.Д.
• Синьков В.В.

• Прикладные науки. Медицина. Технология

• Естественные науки
• Науки о человеке