Статья посвящена исследованию распространения вируса ВИЧ-1 в странах бывшего Советского Союза. Получен срез эпидемии в московском регионе: исследованы биологические и генетические свойства циркулирующих в настоящее время форм вируса. Впервые добыт полногеномный сиквенс рекомбинанта CRF02_AG, циркулирующего в России. Филогенетический анализ показал, что страны бывшего СССР представляют собой единое эпидемиологическое пространство, причем генетический профиль эпидемии определяется главным образом двумя наиболее мощными волнами экспансии вируса. Обе волны начались с локальных вспышек заражений в среде потребителей инъекционных наркотиков (ПИН) (г. Одесса, 1995 г., субтип A, и г. Ташкент, 1998 г., CRF02_AG) с последующим быстрым распространением по странам бывшего СССР и различным географически разобщенным регионам России. В настоящее время происходит углубление эпидемии с прогрессирующим захватом гетеросексуальной группы риска заражения, а также с возникновением новых рекомбинантов между субтипом A и CRF02_AG. Существенное значение имеют также две минорных волны эпидемии с центрами в г. Николаев (1996 г., субтип B, клада IDU-B) и в г. Калининград (1996 г., CRF03_AB). Таким образом, при подборе прототипных штаммов ВИЧ-1 в качестве источника эпитопов для конструирования отечественных анти-ВИЧ-вакцин необходимо использовать по меньшей мере штаммы субтипа A и CRF02_AG. Причем предпочтение следует отдавать отечественным изолятам, поскольку генетическое разнообразие в пределах отечественных кластеров A-FSU и AG-FSU существенно ниже, чем в родительских африканских кластерах A1 и CRF02_AG.