Рассматривается метод актуализации глубин прибрежных акваторий по данным много- и гиперспектральной съемки в видимом и ближнем инфракрасном диапазонах спектра. Восстановление глубины для каждого элемента изображения производится на основе решения обратной задачи, заключающейся в обучении искусственной нейронной сети с помощью полуаналитической модели переноса излучения в воде, учитывающей эффекты рассеивания и поглощения света в подводном световом поле, как минимум в трех информативных спектральных каналах для каждого типа дна. При этом предусмотрена возможность корректировки процесса обучения с помощью регрессионных алгоритмов определения органических и минеральных примесей в воде по их натурным измерениям. Выполнено пополнение библиотеки спектральных характеристик различных типов дна и найдены информативные признаки их идентификации. Результаты апробированы по данным авиационных и космических гиперспектральных съемок.