Статья посвящена изучению пространственного распределения заболеваемости клещевым энцефалитом (число случаев на 100 000 человек) на территории Российской Федерации в период с 2001 по 2011 гг. В основу составленных мелкомасштабных карт положено наличие случаев заболевания в административных районах. Представленная картина уточняет распространение и уровень заболеваемости клещевым энцефалитом на территории страны. Опробованный метод составления карт распространения заболеваемости клещевым энцефалитом может быть применен для оценки заболеваемости других природноочаговых болезней.