Установление структуры и ареалов популяций фитопатогенных грибов имеет не только научную значимость, но и важное практическое значение для селекции и распределения в агроценозах болезнеустойчивых сортов, повышения эффективности защитных мероприятий, улучшения экологической обстановки на посевах сельскохозяйственных культур. В последнее десятилетие разработан ряд новых подходов в методах анализа популяций. В частности, разработаны новые типы молекулярных маркеров, техника скоростного секвенирования, внедрены новые аналитические программы. Это позволило уточнить структуру и степень локализации ряда популяций фитопатогенных грибов. Некоторые виды фитопатогенных грибов имеют широкий ареал распределения. К ним относятся многие виды ржавчинных грибов, как, например, Puccinia triticina, P. graminis, P. striiformis и некоторые виды гемибиотрофных грибов – Cochliobolus sativus, Mycosphaerella graminicola и Phaeosphaeria nodorum. В частности, показано, что на территории России существуют по меньшей мере 3 популяции P. triticina, различающиеся по вирулентности. Известны виды с узкой локализацией, например, Pyrenophora teres и Fusarium oxysporum. Узколокальное распределение популяций возбудителей болезней требует иного подхода в использовании генов устойчивости, чем для популяций, имеющих широкий ареал.