В настоящее время вопросы развития здравоохранения входят в число приоритетов экономической и бюджетной политики государства, что является свидетельством достигнутого в обществе мнения относительно роли здравоохранения в социальноэкономическом развитии страны. Одним из первоочередных направлений деятельности России является оптимизация финансовых ресурсов, направляемых на финансирование здравоохранения, и повышение эффективности и рациональности их использования. В статье представлена методология государственного внутреннего государственного финансового контроля в отрасли здравоохранения, предложена система показателей оценки эффективности расходования государственных финансовых ресурсов медицинской организацией. Цели и задачи. Раскрыть современное состояние государственного финансового контроля в отрасли здравоохранения. Поставлены задачи: исследовать внутриведомственный и внутрихозяйственный государственный финансовый контроль; детально рассмотреть специфику проведения внутреннего государственного финансового контроля и его методологию. Методология. Использованы методы сравнительного анализа, систематизации, классификации, аналогии, сопоставления.