Изучение двустворчатых и брюхоногих моллюсков в Палеонтологическом институте началось уже в 1930-х гг. В послевоенное время оно продолжалось в рамках лабораторий низших моллюсков под руководством А.Г. Эберзина и палеоэкологии, руководимой Р.Ф. Геккером, где работал Р.Л. Мерклин. По этой тематике в институте защищено 13 кандидатских и 7 докторских диссертаций. Долгие годы лидером исследований этих групп в институте была Л.А. Невесская. Ныне двустворчатые, брюхоногие моллюски, скафоподы и ростроконхи изучаются в лабораториях моллюсков и древнейших организмов.