Проведён обзор современного состояния методологической базы биологических методов (биоиндикация, биотестирование) для оценки токсичности вод, донных отложений и подходов к оценке экотоксикологического состояния водных экосистем. Обсуждён прикладной аспект применения методик биотестирования, закреплённых в нормативно-методических документах.