Рассмотрены различные категории видов растений, подлежащих охране в горных районах Южного Дагестана: эндемики, реликты, виды в locus classicus, пограничные популяции, виды, редкие независимо от этих статусов. Обсуждается состояние популяций редких и исчезающих видов. Рекомендуется включить в число официально охраняемых 45 видов. Выявлены причины природного и антропогенного характера, создающие угрозу для естественных местообитаний этих видов. Для эффективной охраны редких видов предлагается создать 4 специализированных заказника.