Цель работы — исследование функционального состояния фитопланктонных сообществ с учетом элементного состава по их биофизическим параметрам. Были измерены биолюминесцентная энергия при химической стимуляции, относительная переменная флуоресценция, а также определены концентрации 46 элементов для фитопланктонных проб в акватории г. Севастополя в летний период Биолюминесцентная энергия при химический стимуляции и относительная переменная флуоресценция измерялись для живых фитопланктонных проб на отдельных приборных комплексах («Свет» и двухвспышечном флуориметре). Элементные концентрации определялись после концентрирования на бумажные фильтры с помощью инструментального нейтронного активационного анализа. С помощью анализа биолюминесценции и флуоресценции фитопланктона в прибрежной зоне акватории г. Севастополя показано, что максимальные значения биолюминесцентной энергии при химической стимуляции и активности фотосинтеза по параметру флуоресценции Fv/Fm характерны для фитопланктона с массовым присутствием клеток <50 мкм и определялись активизацией комплекса родов Sceletonema, Chaetoceros, а также значительным вкладом Protoperidinium, Neoceratium в общую численность клеток. Исследованы коэффициенты биологического накопления (Kb), уровни отношений концентраций элементов к терригенному маркеру (El/Sc), факторы обогащения (EF) для всех проб фитопланктона. Предположили, что повышенное накопление элементов Ti, Cr, Ni, Cu, Ag фитопланктоном на мелководных станциях связано с терригенными потоками веществ, которые переносятся с атмосферными осадками.