Проанализирована связь палеогеографических событий неогена и четвертичного периода на Байкале с формированием фаунистических комплексов рыб, птиц и их паразитов. Состав паразитов рыб подтверждает, что наиболее длительную изоляцию в Байкале прошли представители эндемичных байкальских Cottoidei, а рыбы бореального равнинного комплекса заселили озеро сравнительно недавно и, возможно, проникали сюда неоднократно. Современный состав водных птиц свидетельствует о напряженных условиях их обитания в Прибайкалье в четвертичном периоде и о значительной изменчивости их фауны в климатических циклах плейстоцена за счет периодических заселений Байкала птицами.