Целью нашего исследования было выявление особенностей взаимодействия малой РНК VrrA и мишени — матричной РНК ompT штаммов V. cholerae с доступной геномной информацией. Эксперимент проводили in silico на 210 штаммах (N16961 рассматривали в качестве референтного), при этом оценивали свободную энергию гибридизации мишени с последовательностью малой РНК и участвующие в связывании позиции в последовательностях. Степень репрессии белка OmpT малой РНК VrrA принималась пропорциональной увеличению энергии гибридизации.