Спирохета Borrelia miyamotoi впервые была обнаружена в Японии в 1995 г. в клещах I. persulcatus, и в настоящее время известно, что ДНК этой бактерии обнаруживается в клещах I. ricinus, I. persulcatus, I. scapilaris, I. pacificus, I. dentatus. Также методом ПЦР B. miyamotoi выявляют в тканях птиц (Meleagris gallopavo, Cardinalis cardinalis) и диких грызунов. С использованием разработанной в ЦНИИ эпидемиологии методики выявления ДНК B. miyamotoi в биологических образцах было изучено 1090 клещей I. ricinus, 1958 клещей I. persulcatus, собранных в 2006–2012 гг. в центральном и северо-западном регионе (Московская, Ярославская, Костромская, Липецкая, Вологодская области), Поволжье (Удмуртия, Кировская область), на юге России (Ставропольский край), Урале (Свердловская, Челябинская, Курганская области) и в Сибири (Новосибирская и Иркутская области), а также в восточном Казахстане; 280 мелких млекопитающих, включающих Myodes glareolus (240) и 40 экземпляров других грызунов, относящихся к видам Apodemus uralensis, Mus musсulus, A. flavicollis и M. rutilus, отловленных в Удмуртии в 2011–2012 гг.