ДЕКОМПОЗИЦИЯ СТРУКТУРЫ ПАТТЕРНА СКРЫТОЙ ПРОФИЛЬНОЙ ПЕРИОДИЧНОСТИ В ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК

скрытая профильная периодичность спектральностатистический подход кодирующие районы ДНК декомпозиция паттерна периодичности.

ИОНОСФЕРНАЯ ОШИБКА ТРАЕКТОРНЫХ ИЗМЕРЕНИЙ ДАЛЬНОСТИ КОСМИЧЕСКИХ АППАРАТОВ, О СОБСТВЕННЫХ ЗНАЧЕНИЯХ ПОСТОЯННОЙ РАСПРОСТРАНЕНИЯ В ПЛОСКОМ ВОЛНОВОДЕ, ...

В. А. Кутыркин , М. Б. Чалей ДЕКОМПОЗИЦИЯ СТРУКТУРЫ ПАТТЕРНА СКРЫТОЙ ПРОФИЛЬНОЙ ПЕРИОДИЧНОСТИ В ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЯХ ДНК Рассмотрены методы декомпозиции случайных паттернов периодичности кодирующих последовательностей ДНК, в которых наблюдается скрытая профильная периодичность. <...> E-mail: vkutyrkin@yandex.ru, maramaria@yandex.ru Ключевые слова: скрытая профильная периодичность, спектральностатистический подход, кодирующие районы ДНК, декомпозиция паттерна периодичности. <...> Понятие скрытой профильной периодичности (профильности) в последовательностях ДНК введено в работе [1]. <...> Для распознавания наличия профильности в ДНК был разработан специальный спектрально-статистический подход [2, 4]. <...> Согласно этому подходу, последовательность ДНК рассматривается как реализация случайной строки, составленной из независимых случайных букв, каждая из которых задается вероятностным распределением четырех букв алфавита ДНК, соответствующих четырем нуклеотидам (нукл.) <...> Такую случайную строку называют периодичной, если ее можно представить в виде последовательного повторения некоторой подстроки, называемой паттерном периодичности. <...> Если вся строка периодична, ее называют случайным тандемным повтором, определяемым таким паттерном. <...> В этом случае паттерн, состоящий из строки случайных букв, определяет мультиполиномиальную схему из N независимых испытаний, где N — длина случайного тандемного повтора и его реализаций (последовательностей ДНК). <...> При этом паттерн в виде заданной строки случайных букв определяет профиль мультиполиномиальной схемы из N независимых испытаний. <...> Таким образом, мультиполиномиальная схема получена соответствующим сцеплением полиномиальных схем, каждая из которых определяется одной из случайных букв в составе паттерна. <...> Разработанный спектрально-статистический подход [2, 4] позволяет оценить не только период скрытой профильной периодичности последовательностей ДНК, но и ее случайный паттерн. <...> Поэтому <...>

• Похожие документы из РУАЭСТ
• |
• Похожие документы из Руконт