В статье представлены результаты разработки метода выявления и генотипирования бактерий Pasteurella multocida 5 капсульных групп и Mannheimia haemolytica А1 на основе мультиплексной полимеразной цепной реакции (ПЦР) с электрофоретической детекцией. Диагностическая чувствительность разработанного метода составила 10 КОЕ/мл при исследовании чистых культур и 10КОЕ/г при исследовании биологического материала. При исследовании 260 проб биоматериала от больных животных выявили Pasteurella multocida в 50%, а Mannheimia haemolytica в 11,2% исследованных проб. Нами не установлена циркуляция среди восприимчивого поголовья животных капсульных групп Pasteurella multocida В и Е. В большинстве исследованных проб были выявлены группа А, реже D, в одном случае F. На основе филогенетического анализа выявлена циркуляция двух генетических типов бактерии Pasteurella multocida капсульной группы А.