В статье описана сложившаяся к началу 70-х годов XIX века система представлений о предмете изучения медицины и методах исследовательской деятельности врачей. Утверждается, что в середине 70-х годов XIX столетия в медицине возникла объективная потребность совершенно иного, чем прежде, видения изучаемой реальности, разработки и внедрения принципиально новых методологических подходов к ее изучению, что в свою очередь положило начало глобальной научной революции в медицине последней четверти XIX — первой половины XX века. Доказывается, что потребность в новом видении изучаемой реальности стала следствием, во-первых, глубокого внутридисциплинарного кризиса, связанного с осознанием ошибочности существовавших представлений об организме человека и его жизнедеятельности, во-вторых, двух "парадигмальных прививок" из биологии, результаты которых вынудили врачей признать крайнюю неполноту и ошибочность их прежних взглядов на окружающую среду и сущность ее воздействия на организм человека.