До недавнего времени основным методом бюджетного планирования и прогнозирования являлся постатейный (нормативный) метод, когда расходы планировались постатейно в соответствии с утвержденной бюджетной классификацией. При использовании данного метода акцент делался на анализе затрат и целевом использовании средств. Бюджетополучатели составляли сметы расходов. Данные сметы анализировались и корректировались распорядителями бюджетных средств и после передавались на согласование правительству. Если общая сумма сметных заявок превышала величину запланированных доходов, то выявлялись наиболее важные затраты, а по остальным происходило сокращение расходов. Главным недостатком данного метода являлось то, что он не предполагал анализ эффективности, а, следовательно, необходимости финансирования того или иного направления. На сегодняшний день используется программно-целевой метод. Он предполагает разработку бюджетного проекта, исходя из стратегических целей социально-экономического развития, проводит оценку конечных результатов, а также определяет эффективные пути и средства для их достижения и ресурсного обеспечения. То есть его задача заключается в определении приоритетных целей и задач, разработке мероприятий по их достижению в установленные сроки при сбалансированном обеспечении ресурсами с учетом их эффективного использования. Таким образом, федеральная программа повышения эффективности бюджетных расходов активно внедряет программно-целевой метод на всех уровнях бюджетной системы РФ.