В статье исследуются проблемы, возникающие при распределении доходов между различными уровнями публичной власти — Российской Федерацией, субъектами РФ и муниципальными образованиями. Автор анализирует понятие федерализма в налогово-бюджетной сфере, систему налогов и сборов РФ, налоговые полномочия субъектов РФ и муниципальных образований, а также систему перераспределения доходов между звеньями бюджетной системы РФ. Исследованы методы передачи доходов между уровнями бюджетной системы — метод отчислений от федеральных и региональных доходов и метод оказания прямой финансовой поддержки. Методологическую основу исследования составили диалектический метод познания правовой действительности, системно-структурный, логический, формально-юридический, историко-юридический, сравнительно-правовой методы. В статье проведено комплексное исследование проблем, возникающих как при введении и установлении региональных и местных налогов, а также закреплении налоговой нормотворческой компетенции субъектов РФ и муниципальных образований, так и перераспределении федеральных и региональных доходов между звеньями бюджетной системы. Проведенный анализ позволил прийти к выводам о необходимости внесения изменений в Бюджетный кодекс РФ, в частности закрепления понятия «регулирующие доходы» и установления временных ограничений по их установлению. Кроме того, сделан вывод о необходимости изменения порядка исчисления и уплаты налога на доходы физических лиц и налога на прибыль организаций.