В статье дана детальная характеристика анатомо-функциональных особенностей желудочнокишечного тракта новорожденных детей, а также выделены наиболее значимые патологические факторы, способствующие развитию функциональной патологии верхних отделов желудочно-кишечного тракта в неонатальном периоде. Описаны патогенетические механизмы развития микроаспирации желудочного содержимого, а также характер влияния микроаспирации желудочного содержимого на бронхолегочную систему у новорожденных.