В статье рассматриваются факторы, влияющие на развитие биоэнергетики; особое внимание уделено экологическим и природным характеристикам территорий, рассматриваемых как площадки для размещения биотехнологических проектов в России. Структурированы факторы, влияющие на реализацию программ по биоэкономике; представлен перечень пилотных регионов по развитию одной из составляющих биоэкономики – биоэнергетики. Произведен анализ существующего на сегодняшний день в России опыта оценки потенциала биоэнергетики, выявлены слабые стороны существующих методик. На примере Республики Татарстан рассмотрена возможность реализации биоэнергетического проекта на территории с особым статусом использования – культурноисторическом объекте федерального значения острове Свияжск. Проведен анализ экологических проблем территорий с особым статусом и спецификой развития, предложено возможное их решение, выполнена оценка перспектив реализации разработанного проекта с учетом планов развития исследуемой территории.