Развитие метода управления Проектом в эволюционной экономике обусловлено систематизацией и уточнением понятийно-терминологического аппарата методологии управления проектами. В статье предложены авторские методические рекомендации по управлению научно-инновационным комплексом, а так же рассмотрены некоторые вопросы формирования региональной научно-инновационной системы