С целью изучения динамики состояния воздушной среды в учебной комнате в течение дня и поведения школьников при возникновении воздушно-капельных инфекций было проведено комплексное исследование в одной из гимназий г. Казани с использованием гигиенических, микробиологических и масс-спектрометрических методов. Обнаружено повышение общей микробной обсемененности воздуха учебной комнаты в течение учебного дня при отсутствии проветривания, а также при проведении несквозного проветривания с уменьшением времени экспозиции. Показано увеличение видового разнообразия микробиоценозов воздушной среды в течение учебного дня за счет условно-патогенной и патогенной микрофлоры верхних дыхательных путей и кожи при нарушении режима проветривания. Поведение школьников в период эпидемий гриппа и ОРВИ (самолечение, отказ от вакцинации, ношения одноразовых масок, несоблюдение постельного режима и прочее) свидетельствует об их недостаточной санитарной грамотности и способствует распространению вышеуказанных инфекций. Результаты исследований указывают на необходимость санитарно-эпидемиологического контроля микрофлоры воздуха учебных классов образовательного учреждения и разработки новых методических подходов с использованием современных методов (секвенирования, массспектрометрии) к оценке воздушных микробиоценозов в закрытых помещениях, продиктованную возрастающим влиянием этого фактора окружающей среды на здоровье населения, особенно детей и подростков, и обусловливающую усиление направленности профилактических мероприятий на снижение рисков развития заболеваний дыхательных системы.