Предлагается к применению метод двухкритериального анализа национальной агропродовольственной системы для формирования приоритетов и определения предпочтительных методов защиты по каждой группе товаров на продовольственном рынке. Модель двухкритериального анализа продовольственного рынка разработана на инструментарнометодической базе теории сравнительных преимуществ Хекшера – Олина. Индекс продовольственной независимости рассчитан с учетом положений Доктрины продовольственной безопасности России. Конкретизировано содержание дифференцированного подхода государства к формированию политики защиты рынка продовольственных товаров на основе результатов группировки видов сельскохозяйственной продукции по показателям продовольственной безопасности и международной конкурентоспособности.